Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms