Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd1P40201 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd1P40201 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd1P40201 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd1P40201 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chd1P40201 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms