Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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