Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms