Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprkP35822 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprkP35822 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprkP35822 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprkP35822 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms