Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin1P35438 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin1P35438 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms