Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms