Protein–RNA interactions for Protein: P30276

Ccnb2, G2/mitotic-specific cyclin-B2, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb2P30276 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb2P30276 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb2P30276 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms