Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms