Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc1P29341 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms