Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms