Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms