Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra3P26049 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms