Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms