Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZfaP23607 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZfaP23607 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms