Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pou3f1P21952 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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