Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms