Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms