Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VimP20152 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VimP20152 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VimP20152 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VimP20152 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VimP20152 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VimP20152 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VimP20152 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms