Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox5bP19536 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox5bP19536 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox5bP19536 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox5bP19536 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox5bP19536 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox5bP19536 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox5bP19536 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox5bP19536 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox5bP19536 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox5bP19536 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox5bP19536 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox5bP19536 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox5bP19536 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms