Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifrd1P19182 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms