Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl9P18340 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms