Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms