Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sptan1P16546 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sptan1P16546 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sptan1P16546 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sptan1P16546 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sptan1P16546 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sptan1P16546 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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