Protein–RNA interactions for Protein: P15973

Phxr1, Putative per-hexamer repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phxr1P15973 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phxr1P15973 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms