Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30aP15533 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30aP15533 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms