Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms