Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms