Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms