Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp28P10078 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp28P10078 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp28P10078 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp28P10078 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zfp28P10078 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp28P10078 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp28P10078 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp28P10078 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp28P10078 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp28P10078 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp28P10078 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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