Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbk3P0C5K0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms