Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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