Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06336 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06336 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06336 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06336 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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