Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms