Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-AaP01910 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms