Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01896 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01896 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01896 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms