Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01679 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01679 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01679 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01679 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01679 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01679 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01679 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01679 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01679 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01679 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms