Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01669 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01669 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01669 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01669 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01669 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01669 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01669 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01669 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01669 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01669 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01669 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01669 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms