Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01668 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01668 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01668 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01668 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01668 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01668 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01668 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01668 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01668 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01668 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01668 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01668 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01668 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01668 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01668 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms