Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms