Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcn2O88968 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms