Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn2O88703 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms