Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3bO88509 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms