Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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