Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt1O88346 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt1O88346 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms