Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp4O70480 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms