Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxq1O70220 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms