Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrxO55103 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrxO55103 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrxO55103 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrxO55103 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrxO55103 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrxO55103 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrxO55103 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrxO55103 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PrxO55103 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrxO55103 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrxO55103 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms