Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copb2O55029 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms