Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3O54890 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms